Από τον δεύτερο προκριματικό γύρο ξεκινάει την προσπάθεια της η κυπριακή ομάδα.
Ο νικητής του Σλόβαν Μπρατισλάβας-Σουτέσκα θα είναι ο αντίπαλος του ΑΠΟΕΛ στον δεύτερο προκριματικό γύρο του Τσάμπιονς Λιγκ.
Οι αγώνες θα διεξαχθούν στις 23/24-07 και 30/31-07. Ο πρώτος είναι εκτός έδρας.
Τα ζευγάρια του δεύτερου προκριματικού γύρου του Τσάμπιονς Λιγκ:
Αστάνα ή Κλουζ – Μακάμπι Τελ Αβίβ
Φερεντσβάρος ή Λουντογκότετς – Ντουντελάνζ ή Βαλέτα
Ντουντάλκ ή Ρίγα – Παρτιζάν ή Καραμπάκ
Σερίφ Τιρασπόλ ή Σαμπουρτάλο – Ντίναμο Ζάγκρεμπ
Σέλτικ ή Σαράγεβο – Νόμε Κάλου ή Σκέντια
Σούντοβα ή Ερυθρός Αστέρας – Ελσίνκι ή Τορσβάν
Σλόβαν Μπρατισλάβας ή Σουτέσκα – ΑΠΟΕΛ
Βαλούρ Ρέκιαβικ ή Μάριμπορ – Αραράτ ή Αρμενία
Αϊντχόφεν – Βασιλεία
